Los recursos del FEES pueden ser utilizados en cualquier momento con el objetivo de complementar los ingresos fiscales necesarios para financiar el gasto público autorizado en caso de déficit fiscal. Además, pueden utilizarse para la amortización, regular o extraordinaria, de deuda pública y para financiar el aporte anual al FRP cuando así lo disponga el Ministro de Hacienda.

La Ley N° 21.683, modificó en agosto de 2024 la regla de retiro del FRP que se establece en la Ley de Responsabilidad Fiscal. De esta manera, a partir de 2025 el monto de los recursos del FRP que puede ser utilizado anualmente será determinado a partir de una regla de retiro, definida por el Ministro de Hacienda, la cual deberá cumplir con dos objetivos: i) que el monto anual de los retiros desde el Fondo de Reserva sea estable y predecible, y ii) que se mantenga el valor del Fondo y de los aportes en el largo plazo, descontando la inflación.

Los retiros y aportes del FEES y del FRP se formalizan mediante decreto del Ministerio.